行业观察 | Codex BioXp™ 系统深度解析

 

行业观察

—Codex BioXp™ 系统深度解析—

 

基因拼接及纠错技术是基因合成技术中,将短链DNA连接为Kb级基因的两个关键步骤。虽然现代生物技术已经使拼接和纠错成为一件可操作的事,但由于该过程的复杂性及工艺不稳定性,这些任务的完成仍然需要耗费大量的人力成本和时间成本。随着合成生物产业的蓬勃发展以及基因合成需求的急剧增加,许多企业及科研用户翘首以待的是能够拥有一台全自动长链DNA拼接设备。

 

     对此,美国公司Codex DNA率先于2020年提出了解决方案-自动化基因拼接BioXp™ 系统

 

(来源:CodexDNA 官网)

 

Codex DNA公司成立于2011年,是一家为研究人员设计、编码和合成DNA所需端到端解决方案和工具的合成生物学公司。其采用的Gibson组装是一种常用的新兴克隆方案——DNA定向无缝克隆技术。运用简单的等温一步拼接法,通过一种mastermix(含有三种酶)以及一小时左右的孵育即可完成组装。

 

(来源:CodexDNA 官网)

 

Codex DNA公司的BioXp™ 系统,是首个在夜间自动合成片段、克隆、变异文库和mRNA的合成生物学台式工作站,该平台将合成工作流程整合到一个按钮式自动化系统中,有助于研究人员提高生产力、缩短周转时间并拥有完整的工作流程控制,并帮助科学家克服因构建或获取DNA和mRNA的替代方法的周转时间、成本或复杂性而造成的工艺限制。

 

(来源:CodexDNA 官网)

 

BioXp™ 系统作为下一代高通量合成生物学工作站,为工作流程开发提供了多功能性,但其在中国市场的反馈却并不理想,究其原因我们考虑为以下三个方面:

 

高成本:BioXp™ 系统的设备和试剂盒价格较高,对于预算有限的实验室和研究机构来说不太实际。且因BioXp™ 系统及其所使用的试剂耗材均需以进口形式获得,涉及到国际采购和海关清关等问题,加大了客户的购买和运输成本。

 

低时效:BioXp™ 系统要求必须使用其定制合成的Oligo才能正常使用设备,从国内用户提供序列信息到Codex DNA公司,再由其制成试剂盒后发往国内,用户在接到试剂盒后通过机器识别特有二维码开始拼接基因,整个流程或需1-3个月,周期远超目前基因合成服务周期。加之设备购置需经美方审批,在繁复的流程中最终成交率尚不足20%。

 

难保密:BioXp™ 系统需要用户将待合成的序列信息提交到Codex DNA公司(美国),该公司服务器位于境外,对于一些高敏感度、对保密性要求高,不便提供序列信息的相关机构来说,使用该系统存在信息泄露风险。

 

 

创建时间:2023-11-07 15:34